Фамилия Панфилочкин хранит память о личном имени, от которого была образована, и в основе её лежит не прозвище и не род занятий, а крестильное имя Памфил. В переводе с греческого оно означает «всеми любимый», что делает фамилию своеобразным пожеланием доброй славы её первому носителю.

Разбирая словообразовательную цепочку, мы видим редкий для русских фамилий путь. Сначала от полной формы имени Памфил (в народном произношении — Панфил) образовали уменьшительно-ласкательный вариант Панфилочка. Такая форма с суффиксом -очк- звучала тепло и фамильярно, её могли использовать в кругу семьи или близких знакомых. Именно эта производная, а не само имя, легла в основу фамилии. Суффикс -ин, добавленный к основе, указывает на принадлежность: Панфилочкин буквально значит «сын Панфилочки», то есть потомок человека, которого ласково звали Панфилочкой.

Такая модель — от уменьшительного имени через притяжательное прилагательное — типична для русских фамилий, но конкретная форма Панфилочкин встречается заметно реже, чем более распространённые Панфилов или Панфильев. Это говорит о том, что фамилия закрепилась в определённой местности или даже в рамках одного рода, где ласкательное имя прижилось настолько прочно, что перешло в официальное семейное прозвание.

Интересно, что имя Памфил в русской традиции не было широко распространено, оно встречалось в основном среди духовенства и образованных слоёв населения, хотя народная форма Панфил звучала проще и встречалась чаще. Поэтому фамилия Панфилочкин может указывать на предка, который носил это имя не случайно, а по церковному календарю, где память святых Памфила отмечается несколько раз в году.

Стоит отметить, что в некоторых говорах имя Панфил могли произносить как Панфила или даже Панхвил, что породило целый куст однокоренных фамилий: Панфилов, Панфилкин, Панфиловский. Фамилия Панфилочкин стоит в этом ряду особняком благодаря двойному уменьшительному суффиксу, который придаёт ей оттенок особой теплоты и неформальности. Сейчас она встречается нечасто, что делает её носителей обладателями редкого и выразительного семейного имени, напрямую связанного с личным именем далёкого предка.