Фамилия Панкратенко — типичная украинская фамилия, которая говорит о происхождении её носителя от человека по имени Панкратий. В основе лежит крестильное имя, которое пришло на Русь вместе с православием из Византии. Древнегреческое слово «панкратос» (pankratos) переводится как «сильнее всех» или «всемогущий», поэтому имя Панкратий давали с пожеланием ребёнку силы и могущества.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: к основе имени Панкрат- (в народной форме, без «ий») добавили типичный украинский патронимический суффикс -енко. Этот суффикс в украинском языке обозначал «сын такого-то» или «потомок такого-то». Так что Панкратенко буквально — «сын Панкратия». Такая модель была массовой на Левобережной Украине и в Запорожье, где фамилии на -енко складывались в XVII–XVIII веках.

В русской среде имя Панкратий часто упрощали до Панкрат или даже Панкраш, отсюда пошли родственные фамилии Панкратов, Панкратьев, Панкрашин. Украинский вариант Панкратенко сохранил более архаичную полную форму основы, что отличает его от русских аналогов. Интересно, что в некоторых говорах имя переосмысляли: его сближали со словом «пан» (господин, помещик), из-за чего возникала народная этимология «сын пана». Однако это вторичное сближение, и оно не отражает реального греческого источника.

Поскольку фамилия образована от крестильного имени, а не от прозвища или ремесла, точных сведений о занятиях первых Панкратенко нет. Скорее всего, это были казаки, крестьяне или мещане — люди разных сословий, которых объединяло только имя предка. Географически фамилия распространена по всей Украине, но чаще встречается в центральных и восточных областях, что соответствует зоне активного бытования фамилий на -енко. В России носители Панкратенко появились в результате переселений и миграций, поэтому фамилию можно встретить в разных регионах, хотя она и сохраняет явный украинский колорит.