Фамилия Пантё — редкий случай, когда написание подсказывает произношение, а оно, в свою очередь, ведёт к основе. Ударение в ней падает на последний слог: Пантё. Это сразу отличает её от более распространённых Пантелеевых или Пантелеев, где ударение обычно на «е». Сама фамилия, скорее всего, является усечённой или диалектной формой от канонического имени Пантелеймон.

В основе лежит греческое имя Пантелеймон, означающее «всемилостивый». В народной речи имя часто сокращали: Пантя, Пантюха, Пантёха. Форма «Пантё» могла возникнуть как прозвище или обиходное имя, которое затем закрепилось в качестве фамилии. Характерный суффикс «-ё» в русских фамилиях встречается нечасто и обычно указывает на южнорусское или украинское происхождение, где ударные окончания в фамилиях — норма.

Географически фамилия Пантё тяготеет к югу России, Украине и Белоруссии. Встречается она крайне редко, что делает её уникальной. В дореволюционных списках и современных базах данных носителей единицы, в основном на юге России и в восточных областях Украины. Это не фамилия дворянского сословия — скорее всего, она принадлежала крестьянам или мещанам, где усечённые формы имени были в ходу.

Словообразовательная модель проста: основа «Пант» (от Пантелеймон) + фамильный суффикс «-ё», который в данном случае выполняет роль окончания и одновременно указывает на происхождение от прозвища. По сути, это «сын Пантё» или «человек из рода Пантё». В отличие от фамилий на «-ов» или «-ин», которые образуются от притяжательных прилагательных, эта модель фиксирует прозвище в чистом виде.

Споров о происхождении почти нет: альтернативные версии, например, от слова «панта» (дорога, тропа) или от тюркского «пант» (клятва), маловероятны, так как не объясняют ударного «ё» и не находят подтверждения в антропонимике. Самая правдоподобная версия — народная форма имени Пантелеймон, которая выжила как фамилия в узком региональном ареале.