Фамилия Пархотюк — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -ук/-юк. Этот суффикс в украинской ономастике выполняет ту же роль, что и русские -ов/-ев: он указывает на принадлежность, родство или происхождение, буквально «сын» или «потомок» того, кто назван в основе. Таким образом, Пархотюк означает «сын (или потомок) Пархота».

Основа фамилии — Пархот — скорее всего, является производной формой от крестильного имени Парфений (греч. παρθένος — «девственник, чистый»). В народной речи имя Парфений часто сокращалось и видоизменялось: на русской почве — Парфен, Парха, Парша; на украинской — Пархім, Пархот. Фамилия Пархотюк закрепилась именно в западноукраинских землях, где суффикс -ук особенно распространён. Встречается она также в приграничных районах Беларуси и Польши, что говорит о миграции носителей.

Менее вероятна, но возможна связь с прозвищем Пархот, которое могли дать человеку по внешности или поведению. В украинских говорах «пархотливий» — шелудивый, неопрятный, от слова «пархи» (короста, чесотка). Однако эта версия менее убедительна, так как прозвища с негативным оттенком редко становились основой для фамилий с патронимическим суффиксом, если только не закреплялись в ироничном или бытовом смысле.

Фамилия Пархотюк не относится к числу дворянских или шляхетских. Её носители — это, как правило, крестьяне или мещане из Волыни, Подолья или Галичины. В официальных документах Российской империи фамилию могли записывать с искажениями: Пархотюк, Пархотюк, Пархотюк. В советское время написание унифицировали, но в польских метриках XIX века встречаются варианты Parchociuk и Parchotuk.

Однокоренные фамилии — Пархотенко, Пархотов, Пархоменко, Парфенов — различаются по территории и суффиксам. Пархотюк остаётся верным украинской модели, и по суффиксу можно сразу определить, что предки носителя жили на западе Украины, где -ук/-юк — главный фамильный показатель.