Фамилия Пасее — редкий случай, когда русская по форме фамилия почти наверняка имеет не славянское, а тюркское или кавказское происхождение. Внешне она похожа на притяжательное прилагательное с суффиксом -ев (Пасеев), но пишется без конечного «в», что характерно для фамилий, заимствованных из языков, где этот суффикс не требуется. В русской традиции такое окончание — признак поздней фиксации или диалектного влияния.

Основа «Пасе» восходит к тюркскому или кавказскому личному имени. В осетинском языке есть слово «пасе» (пасæ) — «охрана, стража», а также мужское имя Пасе, которое давали мальчикам с пожеланием стать защитником. В тюркских языках (например, в карачаево-балкарском) «пасе» означает «спокойный, степенный», что могло стать прозвищем. В обоих случаях фамилия образована от имени или прозвища отца без добавления русского суффикса — так называемая «усеченная» форма, когда конечный -ов/-ев отброшен или изначально не ставился.

Встречается фамилия преимущественно на Северном Кавказе, особенно среди осетин, а также у народов Дагестана. В русских документах XVIII–XIX веков подобные фамилии нередко записывали без конечного согласного из-за особенностей произношения местного населения или ошибок писарей. Например, осетина Пасе могли записать как «Пасеев», но в быту фамилия сохранила исходный вид.

Другая, менее вероятная версия связывает фамилию с греческим «пасха» (Пасха), что могло указывать на прозвище человека, родившегося или крещенного в этот праздник. Однако географическая привязка к Кавказу и отсутствие характерного греческого суффикса делают эту гипотезу слабой.

Таким образом, предки носителя фамилии Пасее, скорее всего, принадлежали к осетинскому или тюркоязычному народу, а их родоначальник носил имя или прозвище со значением «страж» или «степенный». Фамилия не имеет отношения к русским дворянским родам и сохранилась в исходной, неадаптированной форме.