Фамилия Паудин — редкий случай, когда географическая привязка оказывается важнее морфологии. Скорее всего, это не русская, а финно-угорская фамилия, и её центр — Карелия и соседние районы Архангельской области. В Поморье и Заонежье фамилия Паудин встречается с XVII века, и именно там её корни.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), но основа «Пауд-» не имеет однозначного славянского объяснения. В русских говорах «пауда» или «пауд» не зафиксировано. Зато в карельском и вепсском языках есть корень *pau(d)-, означающий «плохой», «дурной», «хилый». Вероятно, прозвище Пауда могли дать болезненному или невезучему человеку. Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с диалектным «паудить» — «медлить», «нерасторопно делать». Но она слабее: глагол этот редок и локально привязан к тем же северным говорам, куда мог попасть из карельского.

Нельзя исключать и вариант, что Паудин — это русифицированная форма прибалтийско-финской фамилии вроде Паутила или Паудала. В таком случае суффикс -ин заменил местный окончание, а корень остался прежним. В пользу карельской гипотезы говорит и то, что в метрических книгах Олонецкой губернии Паудины записаны как крестьяне-карелы, а не как переселенцы из центральной России.

Социально фамилия почти наверняка крестьянская. Среди Паудиных не известно дворянских родов, а в списках купцов и духовенства она не встречается. Это фамилия северного крестьянина, рыбака или охотника, чьё прозвище со временем закрепилось за потомками.