Фамилия Паустин — редкая, с неочевидной на первый взгляд этимологией. В ней нет привычного славянского суффикса -ов или -ин, образованного от имени отца. Вместо этого прямое окончание -ин, но основа вызывает вопросы. Самая вероятная версия — происхождение от прозвища или имени Пауста, которое в русской традиции могло быть формой крестильного имени Фавст (от латинского faustus — «счастливый», «благоприятный»). Переход «ф» в «п» — известное явление в народной речи, особенно в западных и южных говорах, где «Пауст» звучало естественно, как и фамилии Паустов, Паустовский. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Паустин, то есть сын или потомок Паусты.

Менее распространённая, но не исключённая версия связывает фамилию с немецким корнем. В немецком языке фамилия Baust или Baustin (с озвончением «п» в начале) могла означать «строитель» (от bauen — строить). Однако для русского уха форма Паустин звучит как типичная фамилия на -ин, а не как заимствование, поэтому версия славянского происхождения от канонического имени выглядит правдоподобнее.

Географически фамилия Паустин встречается очень локально. По данным современных переписей, основные носители сосредоточены в центральных областях России и на юге, что косвенно подтверждает связь с южнорусскими говорами, где «ф» заменялось на «п» или «хв». Если предки носили эту фамилию, они, скорее всего, были крестьянами или мещанами — фамилия не дворянская, без приставки и без указания на знатное происхождение.

Однофамильцев у Паустиных почти нет, что делает фамилию ярким маркером конкретного рода. В дореволюционных источниках она не фиксируется как распространённая, что говорит о её позднем закреплении — возможно, в XIX веке, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам или по именам отцов. Таким образом, Паустин — это «сын Паусты», где Пауста — народная форма имени Фавст, означавшего «счастливый».