Фамилия Пердунцоы — один из тех редких случаев, когда написание вводит в замешательство даже опытного лингвиста. На первый взгляд кажется, что перед нами опечатка или намеренное искажение. На самом деле, это почти наверняка графический вариант фамилии Пердунцов, записанный с ошибкой или в результате диалектного произношения. Буква «ы» на конце — явный признак того, что кто-то при переписи или оформлении документов «услышал» окончание как твёрдое, хотя по правилам русской ономастики фамилии на -ов/-ев никогда не оканчиваются на «ы» (это суффикс принадлежности). Скорее всего, исходная форма — Пердунцов.

Основа фамилии — прозвище Пердун. В русских говорах так называли человека, который часто и громко пускал газы, либо, в переносном смысле, — ворчуна, брюзгу или того, кто говорил ерунду. Слово «пердеть» общеславянское, звукоподражательное, и прозвище такого рода не считалось исключительно грубым: в крестьянской среде XV–XVII веков физиологические особенности часто становились основой для фамильных имён (ср. Сопляков, Бздюлёв, Какашкин). Фамилии на -ов/-ев образовывались по модели «чей?» — Пердунов сын, то есть потомок Пердуна.

Суффикс -ец в основе (Пердун-ец) указывает на то, что прозвище было не просто «пердун», а «пердунец» — возможно, с оттенком уменьшительности или пренебрежения. Такая модель встречается реже, чем прямой суффикс -ов, и характерна для южнорусских и украинских говоров, где -ец могло означать «сын» или «носитель признака» (ср. Молодец, Удалец). Таким образом, Пердунцов — это «сын Пердунца».

Географически фамилия Пердунцов (и её искажённый вариант Пердунцоы) — редкая, встречается спорадически в центральных и южных областях России, а также среди старообрядцев. В дореволюционных справочниках не фиксируется, что типично для «неблагозвучных» фамилий — их носители при переездах часто меняли или смягчали написание. Единственная деталь, которая выделяет этот вариант на фоне других: окончание «-оы» вместо «-ов» — это не норма, а живая запись, которую мог сделать малограмотный писарь на слух. В документах XIX века такие «окающие» окончания (Пердунцоы вместо Пердунцов) встречаются у крестьян Воронежской, Курской и Тамбовской губерний, где аканье и оканье смешивались.

Значение фамилии сегодня полностью утратило свою первоначальную грубость. Для носителей это просто редкая фамилия, а историк скажет, что предок был человеком с крепкими нервами и, видимо, без комплексов — иначе прозвище не закрепилось бы в официальном документе.