Фамилия Перепутенко — яркий пример того, как прозвище, данное человеку за особенность речи или поведения, закрепилось в официальном родовом имени. Её основа — корень «перепут-», который в русских говорах напрямую связан с глаголом «перепутать». Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, был невнимательным, постоянно всё путал, ошибался в делах или пересказывал новости с искажениями. В старину подобные «говорящие» имена давали без злого умысла — как бытовую характеристику, которая со временем становилась фамилией для потомков.

Украинский суффикс -енко указывает на происхождение с территории современной Украины или южнорусских земель, где эта модель образования фамилий была особенно популярна. Первоначально Перепутенко означало «сын или потомок Перепута» (так называли отца). В письменных источниках XVIII–XIX веков фамилия могла фиксироваться в вариантах Перепутенко, Перепутинко, Перепутанко — в зависимости от местного произношения и грамотности писаря.

Стоит отметить, что существует и менее вероятная, но возможная версия: основа могла восходить к слову «перепутье» — перекрёсток дорог. В этом случае прозвище Перепута давали человеку, жившему на перекрёстке, или тому, кто постоянно оказывался на распутье, не знал, куда идти. Однако связь с глаголом «перепутать» более логична и подтверждается обилием однокоренных фамилий (Перепутин, Перепутов, Перепуткин), где значение «путаный» прослеживается отчётливее.

В сословном отношении носители фамилии Перепутенко относились преимущественно к крестьянству и казачеству. В ревизских сказках и метрических книгах XIX века эта фамилия встречается в Полтавской, Харьковской и Черниговской губерниях, что подтверждает её украинские корни. В современной России фамилия редкая, но встречается в Краснодарском крае, Ростовской области и в Сибири — там, куда переселялись крестьяне и казаки с Украины.

Таким образом, фамилия Перепутенко — это не искажённая форма какой-то другой фамилии, а самостоятельное прозвищное имя, которое точно и прямо описывало одного из предков: человека, склонного к путанице, ошибкам или нерешительности.