Фамилия Пещеряков образована от прозвища или нецерковного имени Пещеряк. В основе лежит слово «пещера». Но не стоит сразу представлять себе пещерного человека или отшельника — в русских говорах у слова были и другие, более приземлённые значения.

Скорее всего, Пещеряком называли человека, который жил в овраге, лощине или низине, которую в некоторых областях называли «пещерой». В Вятской, Пермской и других северных губерниях «пещерой» могли называть глубокий овраг с крутыми склонами или яму. Таким образом, прозвище могло указывать на место жительства — «живущий в низине, в овраге». Это бытовая, а не мистическая или библейская история.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с ремеслом. В некоторых говорах «пещерником» называли человека, который добывал камень или глину в пещерах, либо работал в подземных выработках. Но прозвище Пещеряк могло закрепиться за любым, кто имел отношение к таким местам, а не только за профессиональным горняком.

По словообразовательной модели фамилия типична для русского севера и востока. Суффикс -як указывает на принадлежность к определённой группе по характерному признаку (сравните: рыбак, добряк, сибиряк). А окончание -ов — это стандартный патронимический суффикс, означающий «сын Пещеряка» или «из рода Пещеряковых».

Фамилия довольно редкая. Её география тяготеет к регионам, где слово «пещера» имело диалектное значение оврага или ямы, — это Кировская область, Пермский край, Удмуртия. Встречается она и на юге, но там, скорее всего, связана с переселенцами с севера.

В целом, фамилия Пещеряков — это типичное «географическое» прозвище, которое закрепилось за семьёй, жившей в характерном ландшафте. Никакой тайны или романтики подземелий в ней нет, зато есть живая связь с народной географией и бытом русской деревни.