Фамилия Пинтэ — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, но не даёт подсказок о происхождении на первый взгляд. В русской ономастике фамилии, оканчивающиеся на -э, встречаются крайне редко и почти всегда указывают на нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, записанная по-русски с французского или румынского/молдавского языка.

Самая вероятная версия — французская основа. Во французском слово «pin» означает «сосна», а суффикс -et образует уменьшительные формы. Таким образом, «pinet» (или «pinette») могло быть прозвищем или топонимическим именем для человека, жившего рядом с сосновой рощей, либо уменьшительным от имени Пин (Pin). В русской передаче конечное «т» могло смягчиться в «ть» или, при адаптации через письменный источник, превратиться в «тэ» — так появилось Пинтэ. Возможно, фамилия пришла в Россию вместе с французскими гувернёрами, мастерами или военнопленными 1812 года.

Вторая версия — румынская или молдавская. В румынском языке «pin» тоже означает «сосна», а суффикс -ete или -ete встречается в фамилиях, обозначающих принадлежность или происхождение (ср. Пинтя — Pințea). Фамилия Пинтэ могла быть записана у молдаван или русифицированных бессарабцев, и окончание -э — результат прямой транслитерации с кириллицы (молдавский алфавит на основе русского). В Бессарабии и на юге Украины такие фамилии не редкость.

Словообразовательная модель проста: основа «пинт-» (от «pin» — сосна) плюс фамильный суффикс -э, который в русском языке не является продуктивным. Это значит, что носители фамилии Пинтэ — потомки либо выходцев из Франции, либо жителей Молдавии или Румынии, чьё прозвище или место жительства было связано с сосной. Географически фамилия встречается единично, в основном на юге России и Украины, что подтверждает вторую версию.

Дополнительная деталь: в русских архивах XIX века фамилия могла записываться как Пинте, Пинтъ или Пинтя — написание Пинтэ закрепилось, скорее всего, при паспортизации XX века, когда требовалась точная передача звучания. Это одна из немногих русских фамилий, где буква «э» пишется после согласного не в заимствованных словах, а в исконно переданной фамилии — что делает её орфографически уникальной.