Фамилия Пинтюков образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность: «сын Пинтюка». Основа здесь — прозвище Пинтюк. Корень фамилии — «пинт-», и это сразу вызывает вопросы, потому что слово не лежит на поверхности.

Самая вероятная версия связывает прозвище Пинтюк с диалектным глаголом «пинтюкать» или «пентюхать», который в русских говорах (особенно северных и среднерусских) означал «бить, колотить», а также «идти с трудом, ковылять». Прозвище Пинтюк могли дать человеку неуклюжему, медлительному или, наоборот, драчливому. В словаре Даля есть слово «пентюх» — неловкий, неуклюжий человек; «пинтюк» может быть его фонетическим вариантом (чередование е/и в безударной позиции). Также существовало слово «пинтюх» в значении «увалень, мешковатый парень».

Менее вероятна, но возможна связь с украинским или белорусским словом «пинта» — так в некоторых регионах называли меру жидкости (от английского pint, заимствованного через польский). В этом случае Пинтюком могли прозвать человека, торгующего спиртным или имеющего отношение к питейному делу, но это скорее позднее и локальное значение.

Суффикс -юк в основе (Пинтюк) — типичный для украинских и белорусских фамилий, где он обозначает уменьшительность или принадлежность к чему-либо (ср. Ковальчук, Бондарчук). Это указывает, что предок носителя фамилии, скорее всего, происходил из западнорусских земель или из южнорусских областей, граничащих с Украиной. Переход от Пинтюк к Пинтюков произошёл уже на русской почве, когда фамилию русифицировали по стандартной модели.

Фамилия редкая, в общероссийских справочниках (например, в списках Боярских книг или у Веселовского) не фиксируется, что говорит о её относительно позднем происхождении — скорее всего, XIX век. Встречается преимущественно в Курской, Белгородской и Воронежской областях, что подтверждает связь с южнорусским диалектным ареалом.

Таким образом, Пинтюков — это «сын Пинтюка», а сам Пинтюк — прозвище, данное за внешность или манеру поведения: неуклюжий, медлительный человек.