Фамилия Пинтисов встречается редко, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, в её основе лежит нецерковное имя или прозвище Пинтис. В русских говорах слово «пинтить» могло означать «шалить, проказничать», а «пинтис» — прозвище шалуна или озорника. Это объяснение выглядит наиболее логичным, поскольку фамилии, образованные от глагольных основ со значением поведения, типичны для русской ономастики.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Пинтисов — буквально «сын Пинтиса». Фамилия могла возникнуть в среде крестьян или посадских людей, где прозвища, закреплявшие за человеком его характерную черту, были обычным делом. В пользу этого говорит и отсутствие фамилии в дворянских родословных книгах — она явно народная.

Менее вероятна, но не исключена связь с диалектным словом «пинта» — так в некоторых областях называли меру жидкости (например, кружку). В этом случае прозвище Пинтис мог получить человек, имевший отношение к торговле или разливу напитков. Однако эта версия слабее, потому что «пинта» — слово заимствованное и в русской деревне было редким, а прозвище, скорее, давали по более понятному признаку.

Фамилия Пинтисов не имеет ничего общего с фамилиями на -ин, образованными от основ на -а/-я (типа Пинтин). Это самостоятельная форма, и её носители — потомки человека, которого в быту называли Пинтис. Скорее всего, предок был заметным в своей среде человеком — возможно, неугомонным или бойким, раз прозвище закрепилось за ним и перешло к детям.