Фамилия Пинтусова — женская форма фамилии Пинтусов, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Пинтус. С первого взгляда корень кажется иноязычным, и это верно: скорее всего, перед нами фамилия, связанная с западной или южной традицией.

Наиболее вероятная версия — польские или белорусские корни. В польском языке слово «pintus» или «pętać» (путать, связывать) могло дать прозвище человеку нерасторопному или, наоборот, тому, кто «путал следы», был хитрым. Однако есть и другая, более конкретная гипотеза: в литовском языке «pintis» означает «плетение», «коса». Пинтусом могли прозвать мастера по плетению корзин, лыка или даже ткача. Учитывая историческое соседство русских земель с Литвой и Польшей (особенно в Смоленской, Брянской, Псковской губерниях), такая фамилия могла возникнуть именно там.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования: «чей?» — «Пинтусов», то есть сын или потомок Пинтуса. Женская форма Пинтусова закрепилась в документах как указание на замужнюю женщину или дочь из этого рода. Фамилия редкая, не встречается в массовых списках дворянских родов, что говорит о крестьянском или мещанском происхождении: предки, скорее всего, были ремесленниками или вольными хлебопашцами на западных окраинах империи.

В написании возможна путаница: иногда фамилию записывали как Пинтус, Пинтусов, а в польском варианте — Pintus. Но именно форма Пинтусова закрепилась за женской линией рода. Если искать аналоги, можно вспомнить фамилию Пинчук (от реки Припять или от «пинчанин»), но Пинтусова стоит особняком: её основа не географическая, а прозвищная, ремесленная.