Фамилия Пищерев — редкий случай, когда основа не бросается в глаза. Если отбросить фамильный суффикс -ев, остаётся корень «Пищер-». Прямого и очевидного слова «пищер» в русском литературном языке нет, поэтому этимологу приходится искать либо в диалектах, либо в искажённых формах других слов.

Самая вероятная версия ведёт к диалектному глаголу «пищать» или существительному «писк». В старых говорах человека могли прозвать Пищерой — за тонкий, писклявый голос или за привычку жаловаться, ныть (ср. «пищать» в значении «плакаться, клянчить»). Суффикс -ер- в русских прозвищах встречается, хоть и не так часто, как -ак или -ун: он придаёт оттенок деятеля, носителя признака. Таким образом, Пищера — тот, кто пищит. Фамилия Пищерев, соответственно, означает «сын Пищеры» или «из рода Пищеры».

Менее правдоподобная, но допустимая версия — связь со словом «пищаль» (старинное ружьё). В этом случае исходное прозвище могло звучать как Пищарь (мастер, делающий пищали, или стрелок из пищали). Однако фонетический переход «пищарь» → «Пищерев» требует дополнительного объяснения (смена суффикса -арь на -ер), что делает эту гипотезу слабее. Если бы фамилия происходила от «пищаль», мы бы чаще встречали форму Пищалев или Пищальников.

География фамилии тоже подсказывает: Пищеревы исторически концентрируются в центральных и северных областях России — в бывших Вятской, Костромской, Вологодской губерниях. Именно там диалектная лексика активно сохранялась, и прозвища по голосу или поведению были обычным делом.

С точки зрения социального состава, фамилия не принадлежала к дворянским или купеческим родам. Скорее всего, первые носители — крестьяне или посадские люди, получившие прозвание в быту. В документах XVII–XVIII веков такие фамилии на -ев от прозвищ на -ера фиксируются как патронимы, но массово закрепляются только после отмены крепостного права, когда крестьянам потребовались официальные фамилии.