Фамилия Плынина — это пример отчества, образованного от прозвища или личного имени с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Плынина означает «дочь (или жена) Плынина», а в мужском варианте Плынин — «сын Плына». В русской ономастике такая модель типична для фамилий, возникших в северных и центральных регионах России, где -ин так же распространён, как -ов на юге.

Основа «Плын-» — редкая и неочевидная. Наиболее вероятное объяснение: это вариант древнерусского слова «плын» или «плен» в значении «пленник», «полонянин». Фамилии от слова «плен» встречаются, но обычно в форме Пленников, Пленов. Форма Плын- могла закрепиться в говорах, где после мягкого согласного «л» звук «е» переходил в «ы» — так называемое «ыканье», характерное для некоторых владимирских и поволжских говоров. Тогда Плын — это тот же «плен», то есть человек, попавший в плен или выкупленный из плена.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «плынить» (медлить, тянуть, лениться). В северных говорах «плыня» могли назвать нерасторопного, вялого человека. Однако эта версия слабее: глагол редкий, и фамилии на -ин от глагольных основ обычно образуются через причастия (например, Бегунов, Ходоков), а не напрямую.

Есть и третья гипотеза: Плын — это сокращённая форма от крестильного имени Полиен (греч. «многолюбимый») или Платон. В народе такие имена часто усекали: Полиен → Плын, Платон → Плын. Тогда фамилия Плынина — просто отчество от разговорного варианта церковного имени. Это правдоподобно, потому что многие русские фамилии образованы именно от сокращённых имён: Плын — как Ваня от Иван, Гриша от Григорий.

Географически фамилия Плынина встречается редко, в основном в центральной России и Поволжье. Встречаются варианты написания с одной «н» — Плынина (через одну «н» — ошибка, если это женская форма от Плынин), но в документах чаще фиксируется двойное «н», как и положено по правилам русской орфографии для суффикса -ин.

Таким образом, предок современных Плыниных мог быть либо человеком, вернувшимся из плена, либо носителем простонародного имени Плын (от Полиена или Платона), либо, реже, медлительным по характеру человеком. Первая версия — самая надёжная, учитывая, что прозвища по обстоятельствам жизни (плен, сиротство, бегство) давались часто и становились фамилиями.