Фамилия Подданкова — женская форма от Подданков, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -ов/-ев типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или мирских имён, и указывает на принадлежность: «сын Подданка» или «из семьи Подданка». Основа здесь — слово «подданок» или «подданный», но в каком именно значении — вопрос.

Самая прямая версия: прозвище Подданок давали человеку, который находился в личной зависимости, был «подданным» какого-либо феодала или государя. В Московской Руси XVI–XVII веков «подданными» называли не всех жителей, а тех, кто принёс присягу (крестное целование) конкретному князю или царю. Такое прозвище могло закрепиться за крепостным крестьянином или за человеком, который особенно рьяно подчёркивал свою лояльность — возможно, с оттенком иронии.

Вторая версия, менее распространённая, но лингвистически возможная: фамилия связана с диалектным словом «подданок» — так в некоторых говорах называли подмастерье или помощника в ремесле (ср. «поддать», «поддавать»). В этом случае прозвище указывало на социальную роль: младший работник, ученик, человек, который «подаёт» мастеру инструменты или сырьё. Однако эта гипотеза слабее, так как в словарях русских говоров такое значение фиксируется редко, а основной массив фамилий на -ов/-ев образован от имён и прозвищ, а не от профессиональных терминов.

Географически фамилия Подданкова встречается в центральных и южных областях России (Тульская, Рязанская, Воронежская области), что совпадает с ареалом бытования «служилых» и «тяглых» прозвищ, связанных с социальным статусом. В XIX веке носители фамилии значились в основном среди крестьян и мещан, что косвенно подтверждает первую версию: предки могли быть потомками людей, чья фамилия закрепилась за их положением «подданных» помещика.

Ударение в фамилии, судя по фиксациям в метрических книгах, чаще падает на второй слог: Подда́нкова. Это отличает её от возможного варианта «по́дданная» и подчёркивает, что основа — не прилагательное, а существительное с суффиксом -ок.