Фамилия Подкидкин — одна из тех, где значение лежит на поверхности, но при ближайшем рассмотрении открывается неочевидная сторона. Основа здесь — глагол «подкидывать», и первая версия, которая приходит в голову, связана с подкинутым ребёнком. В русской традиции фамилии на -ин часто образовывались от прозвищ, данных по жизненному обстоятельству. Подкидкой или Подкидышем могли назвать младенца, которого оставили на пороге чужого дома. В крестьянской среде это было не редкостью: бездетные семьи нередко брали таких детей, и прозвище закреплялось за всем родом.

Однако есть и другой, менее драматичный вариант. В карточных играх «подкидной» — это тот, кто имеет право подкладывать карты. Прозвище Подкидка могли дать завзятому игроку или человеку, который постоянно «подкидывал» работу, поручения, хлопоты. В этом случае фамилия несёт не столько биографический, сколько характеризующий оттенок: предок мог быть непоседой или хитрецом, умело перекладывавшим дела на других.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: сын Подкидки. Модель образования типична для центральных и северных регионов России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на юге. Стоит заметить, что фамилия редкая, не входит в число распространённых. Встречается в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает связь с переселенцами из центральных губерний.

Однокоренные фамилии — Подкидышев, Подкидов — ещё более редки. Подкидкин стоит особняком: если Подкидышев прямо указывает на подкидыша, то форма Подкидкин допускает и игровое, и бытовое толкование. Выбрать одну версию сложно, но ономасты склоняются к «детской» гипотезе: прозвища, данные по обстоятельствам рождения, в России устойчивее и многочисленнее игровых.