Фамилия Подковырин образована от прозвища Подковыра — так в старину могли назвать человека, который любит копаться, дотошно вникать в дело или, напротив, делает всё медленно и вяло. В основе лежит глагол «ковырять» — «копать, рыть, рыться в чём-то» — с приставкой «под». Прозвище цепкое и образное: оно могло прилипнуть и к тому, кто подкапывался под других, выведывая тайны, и к тому, кто работал неторопливо, с прискрипом.

Но у прозвища есть и вторая, более конкретная версия, связанная с ремеслом. В древнерусском быту существовал промысел — «ковыряние» лаптей, то есть их плетение из древесного лыка. Лапти были основной крестьянской обувью, и мастер, который умел их плести быстро и ладно, ценился в деревне. В этом случае Подковыра — профессиональное именование, указывающее на род занятий основателя рода. Слово «подковыра» могло также означать «подковырка», «заноза» — человека колкого, язвительного, который любит поддеть словом.

Словообразовательная модель проста и типична для русских фамилий: к прозвищу Подковыра добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность: Подковырин — «сын Подковыры», потомок человека с таким прозвищем. Суффикс -ин в русской ономастике чаще присоединялся к основам на -а/-я, тогда как -ов/-ев — к основам на согласный. Здесь как раз тот случай, когда форма прозвища определила окончание фамилии.

Какая из версий правдоподобнее? Обе имеют право на существование, но прозвищная, поведенческая, выглядит более универсальной: прозвища по характеру или манере поведения встречались чаще, чем профессиональные именования. Однако и ремесленная версия не слабая — она объясняет, почему прозвище вообще возникло: плетение лаптей было настолько распространённым занятием, что давало множество производных слов и прозвищ.

Фамилия Подковырин — редкая, она не встречается в крупных исторических документах XVI–XVII веков, что говорит о её позднем оформлении, скорее всего, в XVIII–XIX веках, когда прозвища массово закреплялись в качестве фамилий у крестьян после отмены крепостного права. География фамилии преимущественно центральная Россия и Поволжье, где лыко и лапти были в ходу дольше всего. Среди известных носителей фамилии нет громких исторических фигур, но это не умаляет её ценности: за ней стоит живая история конкретного человека, которого современники запомнили по его характеру или ремеслу.