Фамилия Подлинных — редкий образец русской фамилии, образованной по модели родительного падежа множественного числа с окончанием -их/-ых. Такая модель указывает на коллективную принадлежность: «из дома Подлинных» или «из семьи Подлинных». В отличие от более массовых фамилий на -ов/-ев, этот тип закрепился в основном на Русском Севере, в Сибири и некоторых чернозёмных областях, где не было крепостного права и фамилии складывались позже, часто из прозвищ целой семьи или рода.

Основа фамилии — прилагательное «подлинный» в значении «истинный, настоящий, не поддельный». Однако в народной речи у слова был и другой оттенок: «подлинный» могло означать «длинный, долгий, вытянутый» — от диалектного «подлина» (длинный шест, жердь) или «подлинь» (высокий, нескладный человек). В некоторых говорах «подлинный» связывали с «подлиньем» — ленивым, медлительным человеком. Так что прозвище Подлинный могли дать либо за честность и прямоту, либо за высокий рост и худощавость, либо даже за неторопливость в делах.

Филолог Борис Унбегаун в своей классификации русских фамилий относит модель на -их/-ых к «фамилиям-прилагательным в застывшей форме родительного падежа». Такие фамилии почти не склоняются и часто указывают на целый род, а не на одного человека: Подлинных — буквально «из рода Подлинных». Это одна из древнейших фамильных моделей, но в документах она фиксируется сравнительно поздно (XVII–XVIII века), когда крестьяне и посадские люди начали получать наследственные прозвания.

Географически фамилия Подлинных встречается в Курской, Белгородской, Воронежской областях, а также в Забайкалье — там, где оседали переселенцы из центральной России. Встречаемость крайне низкая, что делает фамилию хорошим маркером для генеалогического поиска: если в архивах попадётся запись о Подлинных, скорее всего, это одна и та же родственная группа.

Стоит отличать фамилию от похожих по звучанию, но разных по смыслу: Подлинников (от «подлинник» — оригинал документа), Подлинов (от «под линой» — под рыбой линь) или Подлинцев (с суффиксом -ец, указывающим на выходца из места). У Подлинных корень иной — чисто качественное прилагательное, перешедшее в родовое прозвище.