Фамилия Подставочкина образована от мужской формы Подставочкин. В её основе лежит слово «подставка» или «подставочка» — уменьшительно-ласкательная форма. Чтобы понять, что означало прозвище, нужно смотреть на контекст: в ремёслах подставкой называли деревянную опору, подпорку, деталь ткацкого станка или часть токарного приспособления. В быту — подставку под горячее, поднос, а в переносном смысле — человека, которого «подставляют», используют как ширму. Скорее всего, прозвище Подставочка получил либо мастер, делавший такие предметы, либо человек, выполнявший роль помощника или заместителя, на которого перекладывали часть работы.

Суффикс -к- в основе указывает на уменьшительную форму: не просто «подстава», а именно «подставочка». Такие прозвища с уменьшительными суффиксами часто давали младшим членам семьи или подмастерьям. Фамилия образована по стандартной русской модели на -ин, которая закрепилась за основами, оканчивающимися на -а/-я. То есть Подставочкин — это «сын Подставочки». Женская форма Подставочкина появилась как естественное производное.

В ономастике фамилия редкая. Она не встречается в массовых списках дворянских или купеческих родов. Скорее всего, её носители — выходцы из ремесленной или крестьянской среды центральной России. Географически фамилия может быть связана с регионами, где было развито столярное или ткацкое дело, — например, с Владимирской, Костромской или Ярославской губерниями. Встречаются также варианты написания с одной «к» (Подставочин), но форма с удвоенной «чк» более архаична и точнее передаёт исходное слово.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Подставкин, Подставной — показывает, что все они восходят к одному гнезду значений: либо к предмету, либо к социальной роли. Подставочкина стоит особняком из-за ласкательного суффикса, что делает её звучание более «домашним», неофициальным — возможно, прозвище закрепилось в узком кругу, в одной деревне или слободе.