Фамилия Подюк — редкий пример, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии. Её основа — не имя и не профессия, а название места, а точнее, реки Подюги в Архангельской области. Житель по берегам этой реки или выходец из тех мест получал прозвище «Подюг», а его потомки, по одной из моделей, стали Подюками. Суффикс -юк здесь работает как уменьшительно-притяжательный или просто указывает на принадлежность к роду (ср. белорусские и украинские фамилии на -юк: Гнатюк, Ковалюк). В русском северном говоре такое окончание — редкость, что сразу выделяет фамилию из ряда стандартных «Подюгин» или «Подюжский».

Есть и вторая, более прозаичная версия. В тех же северных диалектах слово «подюжий» означало «крепкий, сильный, дюжий». Фамилия могла возникнуть как прозвище здоровяка: «Подюк» — тот же «подюжий», но с усечением суффикса. Эта гипотеза проще и не требует географического контекста, но слабее: фамилия Подюк встречается именно в Архангельской области и соседних районах Вологодчины, а не разбросана по всей России, как было бы с чисто качественным прозвищем.

Третья версия — отчество от имени Подя (уменьшительное от Поликарп, Ипполит или даже от крестильного Пахомий). Но тогда логичнее было бы ждать форму «Подюков» или «Подин». Формант -юк в русской среде на севере — признак не отчества, а именно прозвищной или топонимической модели. Поэтому река Подюга остаётся самым надёжным якорем.

Что важно: фамилия не крестьянская и не дворянская по происхождению — она из среды свободных государственных крестьян Русского Севера, которые редко имели фамилии до XVII века, а закрепили их в переписях XVIII–XIX веков. Подюки — это люди с берегов реки, которая течёт к Северной Двине, мимо Каргополя и Вельска. Никаких знаменитых носителей в истории не зафиксировано, и это нормально: фамилия осталась локальной, не вышла за пределы своего ареала.