Фамилия Покутнев образована от прозвища Покутень. Скорее всего, оно происходит от слова «покут» - «тихое место», «заупокойная панихида», «кладбище». Возможно, предок обладателя этой фамилии жил недалеко от кладбища, либо часто участвовал в похоронах. Согласно другой версии, в основе прозвища лежит глагол «кутить», но не в прямом значении - «кружить, крутить», а в переносном – «пьянствовать; жить очертя голову, отчаянно проказить, пить, буянить». Таким образом, Покутнем называть пьяницу, буяна. О таких в народе говорили: «Кути и мути – да норови, кабы самому уйти!». Однако в калужских говорах такое прозвище давали и сплетнику. Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, Покутень – нецерковное имя, которое получил ребенок, родившийся в ненастную погоду. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Покутень, со временем получил фамилию Покутнев.