Фамилия Полиниченко — один из тех случаев, когда на слух кажется, что корень ясен, а на деле всё сложнее. Самое простое и лежащее на поверхности объяснение — от имени Полина. Но здесь есть нюанс: Полина — имя женское, а фамилии на -енко в массе своей образовывали от мужских имён и прозвищ. Если бы фамилия пошла напрямую от Полины, мы бы ждали форму Полинин или Полинкин. Значит, основа не женское имя, а мужское прозвище или производное имя.

Вероятнее всего, в основе лежит мужское имя Полиник. Это греческое имя Полиник (Πολυνείκης) означает «многоспорный» или «многопобедный» — так звали одного из сыновей Эдипа в античных мифах, участника похода Семерых против Фив. Имя было известно на Руси через святцы, хоть и редко встречалось в крестьянской среде. От Полиника обычным путём образовали отчество: Полиниченко — буквально «сын Полиника». Суффикс -енко типичен для украинской и южнорусской традиции, он заменял великорусское -ович и указывал на происхождение по отцу.

Есть и вторая, менее мифологическая версия. Полиниченко могло возникнуть от прозвища Полина — не от имени, а от глагола «полить» или «поливать». В южнорусских говорах так могли назвать человека, который занимался поливкой огородов, работал при водяной мельнице или просто имел привычку много лить воды. Прозвища по действиям (Поливай, Поливака) давали часто, а форма Полина могла быть их сокращением. Тогда Полиниченко — «внук или сын Полины» в значении «сын Поливалы». Эта версия объясняет редкий суффикс и то, что фамилия закрепилась именно на юге.

Географически фамилия тяготеет к Украине и южным областям России: Черкасская, Полтавская, Харьковская губернии, а также Кубань. В центральной России она почти не встречается. По сословию носители Полиниченко — почти всегда крестьяне или казаки. Дворянских родов с такой фамилией нет. Написание стабильное, без вариантов: через «и» в первом слоге, с суффиксом -енко.

Если сравнивать с однокоренными, то фамилия Полиниченко стоит в одном ряду с Полиниковым, Полининым и Полинкиным. Но именно форма на -енко — самая редкая и локальная. Она чётко указывает на южное происхождение рода и на то, что предка звали не просто Полиной, а Полиником или Полиной-прозвищем.