Фамилия Полковская — женская форма фамилии Полковский, и её происхождение чаще всего ведёт не к воинскому званию «полковник», а к географическому названию. В русской ономастике фамилии на -ский/-цкий традиционно получали дворяне по названию своих поместий, а позже — священники и выходцы из Западной Руси (современные Беларусь, Украина, Польша). Основа «Полк-» в этом случае — не «воинское подразделение», а топоним: в Польше, Беларуси и на западе Украины есть несколько сёл и местечек с названиями Полки, Полково, Полков. Житель такого села получал прозвание «Полковский» — «тот, кто из Полков». По этой модели образованы и Смоленский (из Смоленска), и Яблонский (из Яблонны).

Суффикс -ск- — типичный признак шляхетских фамилий Речи Посполитой. Если предки Полковских были мещанами или крестьянами, фамилия могла закрепиться за ними при переходе в православие или при унификации документов в XIX веке. В России фамилия встречается преимущественно в западных областях (Смоленская, Брянская, Псковская) и на юге, куда переселялись украинские и белорусские крестьяне.

Есть и вторая, менее вероятная версия: прозвище Полк в значении «военный отряд» могли дать командиру или человеку, служившему в полку. Но тогда фамилия скорее приняла бы форму Полков или Полковников. Форма на -ский указывает именно на «выходца из места», а не на «сына полкового командира».

Интересная деталь: в дореволюционных метрических книгах фамилию часто записывали с двойным «с» — Полковсская, что отражало польское произношение (Polkowska). После реформы орфографии 1918 года написание унифицировали, но в некоторых семьях до сих пор помнят старую форму.