Этимология фамилии Полунов, принадлежащей к древнейшему типу исконно русских фамилий, восходит к имени собственному. В основу фамилии Полунова легло церковное имя Полувий. Имя Полун может являться краткой формой канонического имени Полувий или Поливий, которое в переводе с греческого языка имеют значение «многожизненный». В православную традицию это имя вошло благодаря святителю Полувию, епископу Ринокирскому, день памяти которого приходится на 12 мая. За свою добродетельную подвижническую жизнь святитель Полувий удостоился дара чудотворений. Так, однажды по его молитве бог послал дождь во время засухи и умножил урожай на полях. Кроме этого, имя Полун могло использоваться как краткая форма таких канонических имен как Полиевк, Поликарп и Ипполит. Согласно другой версии, Полуном могли назвать ребенка, родившегося в полночь. В результате, потомок человека, обладающего именем Полун, со временем получил фамилию Полунов. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Полуновых можно лишь на основании генеалогических исследований.