Фамилия Полуновы принадлежит к древнему пласту русских фамилий, образованных от личного имени. В её основе, скорее всего, лежит краткая форма церковного имени Полувий (или Поливий), которое в переводе с греческого означает «многожизненный». Это имя попало в православный календарь благодаря святителю Полувию, епископу Ринокирскому, чья память отмечается 12 мая. Предание приписывает ему дар чудотворения: по его молитве во время засухи пошёл дождь и умножился урожай.

Однако имя Полун могло быть и сокращением от других канонических имён — Полиевк, Поликарп или даже Ипполит. В народной среде длинные и непривычные для слуха имена часто усекали до короткого и удобного в быту варианта. Такой способ словообразования типичен для русских фамилий XVI–XVII веков, когда суффикс -ов присоединяли к основе имени отца, чтобы обозначить принадлежность потомку: Полун → Полунов, то есть «сын Полуна».

Существует и бытовая версия происхождения прозвища. Полуном могли в шутку назвать ребёнка, родившегося в полночь. Такие прозвища, данные по времени появления на свет, встречаются в русской антропонимии нередко — вспомним хотя бы фамилии Вечеров или Носков. Эта гипотеза менее вероятна, чем связь с церковным именем, но полностью исключать её нельзя: в основе фамилии могло лежать и мирское прозвище, которое затем закрепилось за родом.

Примечательно, что фамилия Полунов не получила широкого географического распространения и встречается гораздо реже, чем, скажем, Полуянов или Поликарпов. Это говорит о том, что род мог быть локальным, сосредоточенным в определённых регионах, — возможно, в северорусских землях или в Поволжье, где любили краткие формы имён. В документах XVIII–XIX веков носители фамилии встречаются среди крестьян, мещан и духовенства, что подтверждает её демократическое происхождение.

С точки зрения словообразовательной модели фамилия Полунов безупречна: основа на твёрдый согласный, стандартный суффикс принадлежности -ов. Это типичный образец русской патронимической фамилии, которая закрепилась за потомками человека по имени Полун. Если ваш предок носил эту фамилию, скорее всего, он происходил из семьи, где ценили традицию и держались за память о родоначальнике, чьё имя, пусть и в сокращённом виде, донесли до наших дней.