Фамилия Понизовкин в привычном виде закрепилась за потомками человека, которого в округе знали под прозвищем Понизовка. Основа здесь — украинское слово «пониззя», то есть низина или нижнее течение реки с прилегающей местностью. Так могли назвать того, кто жил в нижней части села или ниже по течению. Прозвище указывало на место жительства, и в этом смысле оно родственно многим «географическим» фамилиям, которые давали по ориентиру на местности.

Суффикс -кин в данном случае работает по простой модели: от прозвища на -ка (Понизовка) образовывали притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?» — Понизовкин, то есть сын, внук или работник Понизовки. Такая словообразовательная цепочка типична для русских фамилий, где основа на гласный или на -а требовала именно суффикса -ин, а не -ов.

Но у этой фамилии есть и вторая, более запутанная история, которая связана не с прозвищем, а с конкретным местом на карте. В Крыму существует поселок Понизовка, и его происхождение напрямую связано с фамилией, точнее, с ее носителями. Земли эти после присоединения Крыма к России Екатерина II пожаловала командиру греческого батальона генералу Ф.Д. Ревелиоти за воинские заслуги. Активное развитие местечка началось в 1828 году, когда дачу и угодья у генерала приобрел промышленник Иван Мальцов. Поселок вошел в состав Симеизского имения Мальцовых, а большую часть территории отвели под фруктовые сады и виноградники.

В начале XX века последние владельцы имения решили извлечь выгоду из земли: разбили ее на участки, провели дороги, устроили водопровод и канализацию, а затем распродали все под строительство частных пансионов. Часть участков купили московские купцы братья Понизовкины. Именно с этой покупки началась курортная история поселка, и именно тогда Понизовка получила свое современное название. Братья построили здесь особняк с островерхой крышей и башенкой, который позже стал дачей. В поселке с 1886 по 1917 год жил художник Архип Иванович Куинджи, что добавляет этому месту отдельной культурной славы.

Так сложилась двойная природа фамилии. В одном случае она чисто прозвищная, указывающая на низменное место жительства предка. В другом — владельческая, закрепившая за поселком имя купцов, которые вложились в его развитие. Какая версия правдоподобнее для конкретной семьи — сказать сложно, но обе имеют право на существование и не противоречат друг другу. Фамилия могла возникнуть независимо в разных местах: где-то от прозвища по рельефу, а где-то — по названию купленного имения.