Фамилия Понкрашен — довольно редкая и прозрачная по происхождению. В её основе лежит имя Панкрат (Панкратий), которое в народном произношении часто звучало как Понкрат. «Панкратий» — греческое имя, означающее «всесильный», «всемогущий». На русской почве оно дало целый ряд фамилий: Панкратов, Панкратьев, Понкратов. Форма Понкрашен стоит особняком.

Ключевая особенность — суффикс -ен, который указывает на украинское или белорусское происхождение. В этих языках фамилии на -ен (а также -ук, -юк, -енко) образуются по модели «сын такого-то». Понкрашен буквально значит «сын Понкрата». Если бы фамилия возникла в великорусских говорах, она, скорее всего, звучала бы как Понкратов или Понкрашин. Суффикс -ен отсылает к западнорусским землям, где имя Панкрат было в ходу, но фамилия получила местную грамматическую огранку.

Встречается и вариант написания с двумя «с» — Понкрассен, но он ещё реже. Встречаются также фамилии Панкрашен, Понкраш, Понкрашев — все они восходят к тому же корню, но различаются по суффиксальной модели. Понкрашен — один из наименее частотных вариантов, что говорит о его локальном бытовании, возможно, в пределах одной или нескольких соседних областей.

Социальный слой, в котором фамилия закрепилась, определить сложно. Имя Панкрат не было исключительно крестьянским или дворянским — его носили и священники, и мещане. Фамилия на -ен могла возникнуть как у казака, так и у крепостного крестьянина, переселившегося из более западных губерний. Однозначной сословной привязки нет, и это нормально для фамилии, образованной от личного имени.

С точки зрения словообразования, фамилия Понкрашен — яркий пример того, как одно и то же имя, попав в разные диалектные и языковые среды, даёт разные фамильные формы. В данном случае мы видим не просто вариацию, а чёткую региональную метку: суффикс -ен выдаёт украинский или белорусский след.