Фамилия Понкратов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Понкратов послужило церковное имя Панкратий. Фамилия Понкратов происходит от крестильного мужского имени Панкратий. Основой для фамилии послужила его просторечная форма – Панкрат (Понкрат). Чередование гласных а/о произошло под влиянием северных, «окающих» говоров. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Панкратий, со временем получил фамилию Понкратов. О точном месте и времени возникновения фамилии Понкратов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Понкратов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.