Фамилия Понтя восходит к каноническому мужскому имени Пантелеймон, которое в переводе с греческого означает «всемилостивый». В основе же фамилии лежит его просторечная форма — Понтя. Скорее всего, основатель рода Понти был выходцем из рабочей или крестьянской среды.