Фамилия Потепун — редкий случай, когда корень слова не бросается в глаза, а суффикс указывает на южное происхождение. Основа здесь — «потоп», но не в значении всемирного бедствия, а в диалектном, более узком смысле. В украинских и белорусских говорах «потоп» могло означать не только наводнение, но и топкое место, болото, сырую низину. Человек, живший у такого места или часто пачкавшийся в грязи, легко получал прозвище Потоп.

Суффикс «-ун» — яркая примета украинской и южнорусской антропонимии. В русском языке он образует названия деятелей (бегун, говорун), а в фамилиях часто закреплял прозвище по характерному действию или свойству. Потепун — это не просто «сын Потепа», а скорее «тот, кто связан с потопом»: либо житель болотистой местности, либо человек, который вечно что-то заливает или пачкает. Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Потепу́н, что тоже типично для украинских фамилий на «-ун».

Встречается фамилия в основном в западных областях России и на востоке Украины, но нигде не образует крупных гнезд. Это фамилия-одиночка, нечастый случай в метрических книгах. Сравните с более распространёнными однокоренными: Потапов, Потепалов, Потепа — все они ведут родословную от того же прозвища, но Потепун выделяется своей словообразовательной моделью.

В сословном отношении носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или мещанам. Дворянских родов с такой фамилией в исторических источниках не зафиксировано. Если искать параллели в современном языке, то Потепун — это примерно то же, что Болотников или Грязнов, только с более прозрачной внутренней формой и характерным южным акцентом.