Фамилия Присеин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корень, стоит начать с суффикса. Формант -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Присеин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Присея. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на -а/-я (ср. Бородин от Борода, Пряхин от Пряха).

Основа Присе- допускает два основных толкования, и оба связаны с глаголом «сеять». Первое — прямое, сельскохозяйственное. В южнорусских и центральных говорах «присеять» означало подсеять, добавить семян к уже посеянному, а «присев» или «присея» — дополнительный засев или участок, засеянный позже. Человек мог получить прозвище Присея, если занимался подсевом на чужих полях, был наёмным сеяльщиком или владел небольшим наделом, который «присеивал» к основному.

Второе значение — переносное, из диалектной лексики. В некоторых областях «присеять» значило «пристать, привязаться, надоесть» (например, «присеялся как банный лист»). В таком случае прозвище Присея мог получить навязчивый, докучливый человек. Этот вариант менее вероятен для фамилии, так как прозвища с негативным оттенком реже становились наследственными, но полностью исключать его нельзя.

География фамилии подсказывает, что корни стоит искать в зоне распространения южнорусского акающего говора. Фамилия Присеин встречается в Воронежской, Белгородской, Ростовской областях, а также на Украине, где могла возникнуть в среде переселенцев или под влиянием украинского языка (ср. украинское «присіяти» — подсеять). Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении от одного или нескольких родов.

Есть и более простая, бытовая версия: фамилия могла образоваться от нецерковного имени Присей — уменьшительной формы от Присея, которое, в свою очередь, было прозвищем. В дохристианской традиции имена-прозвища от глаголов были обычным делом (Ждан, Неждан, Сеян). Таким образом, предок носителя фамилии Присеин, скорее всего, был крестьянином-земледельцем, а его прозвище закрепилось за родом как напоминание о занятии или особенности характера.