Фамилия Прокапенко — яркий пример украинской модели фамилии, которая образована от имени или прозвища через суффикс -енко. На востоке Украины этот суффикс был настолько продуктивен, что к началу XX века каждая пятая фамилия в Полтавской, Харьковской и Черниговской губерниях заканчивалась именно так. Прокапенко буквально означает «сын Прокапа» или «потомок Прокапа».

В основе фамилии лежит каноническое имя Прокопий, которое пришло на Русь из греческого языка. Греческое «прокопе» переводится как «преуспеяние» или «успех». В народной среде имя обросло множеством уменьшительных форм: Прокоп, Прокоша, Прокуня и, наконец, Прокап. В украинском произношении ударение обычно падает на второй слог: Прокап. Именно эта краткая форма и стала базой для фамилии.

Стоит отметить, что в русской традиции та же основа дала фамилии Прокопьев, Прокофьев и Прокопович. Прокапенко же — сугубо украинский вариант, который закрепился в южных и центральных областях Российской империи. Если встретить эту фамилию в документах XIX века, можно с высокой вероятностью сказать, что её носитель происходил из казацкой или крестьянской среды Левобережной Украины.

Споров вокруг происхождения практически нет: версия с именем Прокопий — единственная убедительная. Иногда пытаются связать фамилию с диалектным словом «прокапать» (просочиться, пролить), но это натяжка — суффикс -енко в украинском языке почти всегда указывает на отчество, а не на действие. Так что предки современных Прокапенко, скорее всего, были потомками человека по имени Прокап, который, если верить значению его имени, должен был быть удачливым в делах.