Имя Прокопий восходит к греческому «прокопос» – «схвативший меч за рукоятку», по другой версии, «преуспевающий». В основу фамилии Прокопенков легла его разговорная форма - Прокоп. Со временем, род Прокопенко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов.