Фамилия Прончакова — женская форма фамилии Прончаков, и её происхождение стоит искать в мужском прозвище или имени, от которого она образована. Словообразовательная модель здесь типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Прончаков — это сын или потомок Прончака. Основа фамилии — Прончак, которое, скорее всего, является производным от имени или прозвища Проня.

Корень «Прон-» чаще всего связывают с каноническим именем Прокопий (в народном сокращении — Проня, Пронка) или с именем Прохор. В русской ономастике уменьшительные формы на -ак, -як (как Прончак) нередко давали прозвища, которые затем закреплялись в фамилиях. Так, Прончак могло означать «маленький Проня» или «сын Прони», а со временем превратилось в родовое имя.

Менее вероятна, но возможна связь с географическим названием: Пронск — старинный город в Рязанской области, упоминаемый с XII века. Если предки жили в тех краях, прозвище Прончак могло указывать на выходца из Пронска или Пронского уезда. Однако такая версия менее популярна, чем антропонимическая, поскольку суффикс -чак чаще встречается именно в личных прозвищах, а не в топонимических обозначениях.

Сословная принадлежность носителей фамилии не зафиксирована в общих источниках, но суффикс -ов и основа на -ак говорят о том, что фамилия могла возникнуть в крестьянской или мещанской среде, где были распространены прозвища. В дворянских родах чаще встречались фамилии на -ский или с книжными основами.

Таким образом, фамилия Прончакова — это след от прозвища или уменьшительной формы имени, бытовавшего в XVI–XVII веках. Её носительница — потомок человека, которого в округе звали Прончаком, и это имя могло быть как ласковым, так и шутливым.