Фамилия Прончин — редкий случай, когда суффикс -ин почти наверняка указывает на женское имя в основе, а не на мужское. В русской модели отчества суффикс -ин крепится к основам на -а/-я (сын Ильи — Ильин, сын Фомы — Фомин). Мужское имя Проня — разговорная форма от Прокофий или Прохор (через Прокоша, Проня). Если бы фамилия образовалась от него, мы бы ждали форму Пронин. А здесь — Прончин, с дополнительным ч перед суффиксом.

Этот ч — верный признак того, что в основе лежало женское имя Проня, точнее, его ласкательный вариант Пронча. В крестьянской среде фамилии на -ин нередко давали по матери, особенно если она была вдовой или хозяйкой двора: «чей будешь?» — «Прончин», то есть сын Прончи (Прони). Имя Проня в старину было женским, уменьшительным от Пелагея (через Паланя, Проня) или от Аграфена (через Груня, Проня). Обе версии работоспособны, но вторая (от Аграфены) встречается в документах XVII–XVIII веков чаще.

Географически фамилия Прончин тяготеет к центральным и южнорусским областям, особенно к Тамбовской, Рязанской и Воронежской губерниям, где имя Пелагея и его производные были популярны. Встречается она нечасто — это не массовая фамилия, а довольно локальная, что говорит о происхождении из одного или нескольких соседних сёл.

Таким образом, предок носителя фамилии Прончин, скорее всего, был сыном женщины по имени Проня (Пелагея или Аграфена). Фамилия закрепилась за ним либо как «материнское отчество» в быту, либо как прозвище по двору, где хозяйкой была мать.