Фамилия Пруда — редкий случай, когда основа совпадает с формой родительного падежа. Чаще всего такие фамилии (типа «Пруда», «Гора», «Борода») закрепились за человеком по прозвищу, которое так и произносили: «Иван Пруда». То есть предка могли называть Прудом — по месту жительства у пруда или по занятию (например, за прудом следил, рыбу разводил). Но есть и другая версия: фамилия могла возникнуть из украинской или белорусской традиции, где ударение на последний слог («Пруда́») указывает на принадлежность — «сын Пруда». В этом случае Пруд — это уже не водоём, а прозвище от слова «прудить» (запруживать, делать запруду) или даже от глагола «прудить» в значении «бить, колотить» (в некоторых говорах).

Суффикса в фамилии нет — она бессуффиксная, что нехарактерно для русских фамилий, но встречается в южных и западных регионах. По модели образования «Пруда» близка к фамилиям «Скорода», «Губа», «Коса». Географически фамилия тяготеет к западу России и Украине: в переписях XVII–XVIII веков такие формы фиксировались среди казаков и крестьян Черниговщины, Полтавщины, а также в смоленских и псковских землях. В центральной России она почти не встречается — там предпочитали формы с суффиксами: Прудов, Прудников.

Интересно, что в некоторых старых документах фамилию могли записать как «Пруды» (в родительном падеже множественного числа) — это указывает на то, что прозвище относилось к целому роду: «из Прудов», то есть живущие у прудов. Но вариант «Пруда» — более личный, прозвищный. О сословной принадлежности носителей сказать сложно: фамилия редкая, в дворянских родословных книгах не отмечена, скорее всего, крестьянская или мещанская.