Фамилия Пшеничныи — редкий случай, когда написание хранит память о старой орфографии и произношении. Перед нами не опечатка, а историческая форма прилагательного, которая застыла в фамилии. В современном русском языке мы бы написали «Пшеничный», но окончание «-ыи» (а не «-ий») — это след дореформенной орфографии, когда твёрдые прилагательные в мужском роде писались через «ы»: «пшеничный» произносилось как «пшеничны[й]», а на письме передавалось как «пшеничный». В фамилии это окончание сохранилось как архаизм, что указывает на её давнее оформление, возможно, ещё в XVII–XVIII веках.

Основа фамилии прозрачна: «пшеница». Суффикс «-ичн-» здесь указывает на признак — «относящийся к пшенице, пшеничный». По модели образования это типичная «качественная» фамилия-прилагательное, как, например, Сладких или Белых, но в полной, а не усечённой форме. Такие фамилии в русской традиции часто давали не по занятию, а по внешней или бытовой характеристике человека: «Пшеничный» мог означать «светлый, как пшеница» (о цвете волос или кожи) либо «торгующий пшеницей, занимающийся её выращиванием». Второе вероятнее, если учесть, что в южнорусских и украинских землях, где фамилия встречается чаще, пшеница была основным товарным злаком.

Географически фамилия Пшеничныи (и её вариант Пшеничный) тяготеет к югу России, Украине и Беларуси. В украинском языке аналогичная фамилия звучала бы как «Пшеничний», что подтверждает общую восточнославянскую основу. Интересно, что в польском языке есть фамилия Pszeniczny, и это не случайно: польский корень «pszenica» того же происхождения, что и русский, но суффикс «-iczny» даёт похожую модель. Однако русская форма с «-ичн-» — это именно результат восточнославянского словообразования, без прямого польского заимствования.

В отличие от фамилий вроде Пшеничников, которые прямо указывают на профессию (пшеничник — торговец пшеницей), Пшеничныи — это прозвищное прилагательное. Оно могло закрепиться за человеком, который либо внешне походил на пшеничный колос (русые волосы), либо жил на «пшеничном» месте, либо был известен своим пристрастием к пшеничному хлебу. Споров среди этимологов нет: корень и суффикс бесспорны, а написание «-ыи» — лишь орфографический курьёз, который делает эту фамилию заметной в документах.