Фамилия Пунтус является адаптированной прибалтийскими народами формой немецкой фамилии Пунт. Фамилия Пунт образована от немецкого слова Pfunt - «фунт» (мера веса и денежная единица). Следовательно, прозвище Пунт указывало на род деятельности предка, который мог быть весовщиком или купцом.