Фамилия Пустогова — женская форма мужской фамилии Пустогов. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Пустогов, которое, скорее всего, составлено из двух частей: «пусто-» (в значении «пустой, порожний, ничем не занятый») и «-гов» (от «говеть» — поститься, воздерживаться от пищи, или от диалектного «гово» — скот, говядо). Сразу стоит отбросить маловероятную версию о связи с «говно» — в древнерусском языке это слово имело другое значение и редко становилось основой фамилий.

Наиболее правдоподобное объяснение: Пустогов — человек, который «пусто говеет», то есть соблюдает пост формально, без должного усердия, или же тот, кто нарушает пост, ест скоромное в неположенное время. В крестьянской среде, где церковные правила были строги, такое прозвище давали либо ленивому, либо хитрому, либо тому, кто был вынужден работать в пост. Суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ, и указывает на принадлежность: «сын Пустогова».

Фамилия редкая, встречается в основном в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской и Ростовской областях. По данным переписей, Пустоговы не принадлежали к дворянству — это фамилия крестьянская, возможно, однодворческая. Однодворцы, жившие на южных рубежах, часто получали прозвища, отражавшие бытовые детали, и Пустогов могло закрепиться именно в такой среде.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» нет прямого упоминания Пустогова, но модель «глагольная основа + существительное» (Пустогов, Пустовалов, Пустозвонов) описана как типичная для прозвищ, характеризующих поведение. В отличие от более распространённых Пустовалова (от «пусто валять» — бездельничать) или Пустозвонова (пустозвон — болтун), Пустогов имеет конкретную религиозно-бытовую окраску, что делает её уникальной среди «пустых» фамилий.

Таким образом, предок носительницы фамилии Пустогова — скорее всего, крестьянин, получивший прозвище за нерадивое отношение к посту или за то, что в глазах общины выглядел «пустым говейщиком». Фамилия сохранила память о бытовом укладе и церковной дисциплине русской деревни.