Фамилия Пынкова — женская форма фамилии Пынков, и чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с мужским вариантом. Сразу бросается в глаза корень «пын-», который в русском языке не является ни распространённым именем, ни очевидным ремеслом. Это указывает на то, что в основе почти наверняка лежит прозвище.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с диалектным словом «пынка». В северных и сибирских говорах так называли небольшой деревянный сосуд, кадку или бочонок. Прозвище Пынок мог получить либо бондарь, делавший такие кадки, либо человек плотного, коренастого телосложения — «как бочонок». Менее распространённая, но тоже возможная версия — от глагола «пынять» (напирать, налегать), так могли прозвать упрямого или настойчивого человека.

Суффикс «-ов» в фамилии Пынков — классический патронимический (притяжательный) формант, отвечающий на вопрос «чей?». Он указывает, что фамилия образовалась в центральной и северной частях России, в среде крестьян и посадских людей, где такая модель была основной. Таким образом, Пынков — это буквально «сын Пынка» или «человек из рода Пынка».

С точки зрения словообразования фамилия проста и прозрачна: прозвище Пынок (от «пынка») плюс суффикс принадлежности. Важно отличать её от фамилий с похожим звучанием, например, от Пыньковых, где корень мог быть связан с другим диалектным словом — «пынь» (пень, колода), но в случае Пынковых более вероятна именно «ёмкостная» версия.

Встречаемость фамилии невысока, что говорит о её локальном происхождении. Основные очаги бытования — Вологодская, Архангельская и Кировская области, то есть регионы, где слово «пынка» было в ходу. Известных исторических деятелей с такой фамилией нет, поэтому её история — это история простых людей, вероятно, ремесленников или крестьян, чьё прозвище закрепилось за родом на несколько поколений.