Фамилия Рафеенков — один из тех случаев, когда основа не бросается в глаза сразу. На слух она кажется то ли заимствованной, то ли искажённой, но на деле укладывается в старую русскую словообразовательную модель. Чтобы понять её происхождение, достаточно разобрать суффиксы и присмотреться к корню.

Модель очевидна: суффикс -енк- (в диалектной форме -ёнк-) плюс типичный фамильный суффикс -ов. В русских фамилиях -енк(ов) — это вариант, характерный для южнорусских и белорусских земель, где уменьшительные имена и прозвища часто оформлялись через -енко, а при переходе в фамилию на -ов добавляли окончание. Таким образом, Рафеенков — это «сын (или потомок) Рафеенка», а сам Рафеенок — уменьшительное от какого-то более короткого имени.

Корень «Раф-» отсылает к личному имени Рафаил (древнееврейское «Бог исцелил»). В народной среде это имя давали по святцам, но в быту оно быстро сокращалось. Рафаил превращался в Рафу, Рафку, а от Рафки с уменьшительным суффиксом -енок получалось прозвище Рафеенок — «маленький Рафа» или «сын Рафы». Фамилия Рафеенков, следовательно, означает «потомок того, кого звали Рафеенок», то есть внук или правнук человека по имени Рафаил.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и южнорусским областям, особенно к Смоленщине, Брянщине, а также к Беларуси. Там форма на -енков встречается чаще, чем в северных регионах. Встречается и вариант написания через «а» — Рафаенков, но он менее распространён и, скорее всего, отражает колебания в произношении безударного «е».

Иной версии, кроме как от имени Рафаил, у фамилии нет. Попытки связать её с тюркскими корнями или с профессиональным прозвищем (например, от «рафинировать») — натяжки, не подтверждённые ни исторической фонетикой, ни географией бытования. В документах XIX века Рафеенковы фиксируются как крестьяне и мещане, что типично для фамилий, образованных от крестильных имён: церковное имя давали при рождении, а в быту оно обрастало суффиксами, и через поколение закреплялось в качестве родового прозвища.

Таким образом, если ваша фамилия Рафеенков, ваш предок по мужской линии, скорее всего, носил имя Рафаил, а его дети или внуки получили прозвище по отцу — Рафеенки, которое затем и стало фамилией. Ничего экзотического, просто живая народная память о конкретном человеке, которого в семье звали уменьшительно.