Фамилия Ратунова — женская форма от Ратунов, и её разумнее начинать с мужского варианта. В основе фамилии лежит прозвище или неканоническое имя Ратун. Самая прямая версия связывает его с диалектным словом «ратун» — так в некоторых русских говорах называли болтуна, пустомелю, человека, который много и попусту говорит. В этом случае Ратуновыми становились потомки того, кого в округе прозвали за эту черту.

Есть и вторая, менее очевидная, но исторически интересная версия. Ратун могло быть производным от слова «рать» — войско, битва. В древнерусском языке «ратный» означало «воинский», «боевой». Тогда Ратун — это человек, имеющий отношение к военному делу: ратник, ополченец, либо просто воин по характеру. Эта версия правдоподобна, но уступает первой по частоте: прозвища по внешним или поведенческим признакам давали чаще, чем по абстрактным качествам.

Фамилия образована по стандартной модели: основа Ратун + суффикс принадлежности -ов. Суффикс указывает на то, что родоначальника звали Ратун, а его дети и внуки стали Ратуновыми. Форма Ратунова — притяжательное прилагательное в женском роде, по традиции закрепившееся за женщинами в качестве фамилии.

Географически фамилия встречается нечасто, но имеет заметные очаги в центральных и северных областях России — в Вологодской, Архангельской, Костромской губерниях. Это косвенно подтверждает первую версию: северные говоры как раз сохранили слово «ратун» в значении «болтун». В других регионах фамилия редка, что делает её локально окрашенной.

С точки зрения словообразования, Ратунов — типичная патронимическая фамилия от прозвища с суффиксом -ун. Такие суффиксы в русском языке часто образуют имена деятеля или носителя признака (бегун, ворчун, говорун). Ратун — из того же ряда, только с утраченной в литературном языке основой.