Фамилия Русеин — редкий случай, когда географическое прозвище сохранилось в почти не тронутой переделками форме. Её основа — слово «русин» или «русь». В древнерусском языке «русин» означало жителя Руси, но уже к XIV–XV векам у этого слова появилось более узкое значение: так в Великом княжестве Литовском и Речи Посполитой называли православных восточных славян — предков современных украинцев и белорусов. Человек, получивший прозвище Русин, мог быть выходцем из русских земель в польско-литовской среде, либо, наоборот, переселенцем с запада на восток, которого местные выделяли по говору или вере.

Суффикс -ин в фамилии Русеин работает по той же модели, что и в фамилиях Пушкин, Бородин или Гагарин: он указывает на принадлежность к роду того, кого звали Русин. То есть Русеин — буквально «сын Русина» или «из семьи Русина». Написание через «е» (Русеин вместо Русин) — результат поздней канцелярской фиксации: в документах XIX века, когда крестьянам массово присваивали фамилии, писарь мог записать прозвище на слух, добавив привычный суффикс, или же это была попытка отличить фамилию от этнонима.

В ономастике существует версия, что Русеин может восходить не к «русину», а к старому личному имени Рус (сравните с именами Руслан, Русик), но она менее убедительна: имя Рус в древности встречалось редко, а прозвище по этнической принадлежности — одна из самых распространённых моделей в русских фамилиях. Географически фамилия тяготеет к юго-западным областям бывшей Российской империи — Черниговщине, Киевщине, Подолью, где смешение русского, украинского и польского населения делало такие прозвища особенно востребованными.

В отличие от фамилий Русаков или Русинов, Русеин не получил широкого распространения. Это говорит о том, что родоначальник был либо единственным носителем такого прозвища в своей волости, либо фамилия закрепилась поздно, когда основная масса крестьян уже получила более типовые окончания на -ов/-ев. Сегодня Русеин — нечастая, но живая фамилия, сохранившая память о человеке, которого когда-то называли «русином» среди людей иного происхождения.