Фамилия Рыжаченков образована по редкой для русских фамилий модели с суффиксом -енков. Это не ошибка написания и не вариант фамилии Рыжаченко, а самостоятельная форма, характерная для южнорусских и украинских говоров. Если фамилии на -ов и -ин указывают на принадлежность отцу («чей сын?»), то суффикс -енков — это то же самое, но в уменьшительной или «младшей» форме: сын не просто Рыжака, а Рыжаченка. То есть Рыжаченков буквально означает «внук Рыжака» или «сын Рыжаченко».

Основа фамилии — прозвище Рыжак. В русских говорах так называли человека с рыжими волосами, иногда с рыжей бородой. Прозвище было распространённым, неоскорбительным, просто фиксировало яркую внешнюю черту. От него пошли десятки фамилий: Рыжов, Рыжиков, Рыжаков, Рыжкин. Рыжаченков стоит в этом ряду особняком из-за ступенчатого образования: сначала от Рыжака сделали Рыжаченко (сын Рыжака), а потом уже от этой фамилии — Рыжаченков (внук).

Географически фамилия тяготеет к бывшим территориям Слобожанщины и юга России. По данным переписей и телефонных справочников, Рыжаченковы чаще всего встречаются в Белгородской, Воронежской и Ростовской областях. Это зона, где в XIX веке активно смешивались великорусские и малорусские антропонимические модели. Фамилия могла закрепиться в документах как раз в тот момент, когда при переписи населения писарь записывал крестьянина по отцу: «Рыжаченков сын», а позже это стало родовым именем.

Сословно Рыжаченковы, скорее всего, из государственных или помещичьих крестьян. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В списках однодворцев (служилых людей на южных рубежах) тоже встречаются варианты Рыжаковы и Рыжковы, но Рыжаченков — это более поздняя, «крестьянская» ветвь, где суффикс -енков указывает на непривилегированное происхождение.

В современном русском языке фамилия сохраняет ударение на второй слог: Рыжа́ченков. Иногда ошибочно произносят с ударением на «е» (Рыжаче́нков), но это ломает исходную модель — основа Рыжа́к, а не Рыжа́ч.