Фамилия Садонины — довольно редкая и интересная с точки зрения словообразования. В её основе лежит не церковное имя, а прозвище или профессиональное занятие, что сразу выделяет её из ряда патронимических фамилий на -ин.

Самый вероятный корень — слово «сад». В русских говорах «садовник» или «садовод» нередко превращался в краткое прозвище Садоня. Суффикс -оня характерен для северных и северо-западных диалектов (сравните: Садоня, Бороня, Мироня), он придаёт прозвищу уменьшительно-ласкательный или бытовой оттенок. Таким образом, Садоня — это человек, работающий в саду, либо владелец сада, либо тот, кто жил рядом с ним. Фамилия Садонины, соответственно, означает «дети (или потомки) Садони».

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с географическим названием. В некоторых областях (например, в бывшей Новгородской губернии) существовали деревни с корнем «сад» в названии. Житель такой деревни мог получить прозвище Садоня по месту жительства. Однако, учитывая, что фамилия зафиксирована в основном на Русском Севере и в Поволжье, версия с профессиональным прозвищем выглядит убедительнее.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Садонин, то есть сын Садони. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от имён на твёрдый согласный, -ин — обычный способ для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Фамилия не дворянская и не княжеская: она типична для крестьянской и мещанской среды, где прозвища давались по занятию или характерной черте.

Встречается фамилия Садонины в единичных записях по Вологодской, Архангельской и Нижегородской областям. В дореволюционных переписях её носители числились государственными крестьянами и посадскими людьми. Известных исторических личностей с этой фамилией нет — она осталась в тени, что только подтверждает её народное, «земледельческое» происхождение.