В основе фамилии Сафена лежит имя Сафа. В тюркских языках, особенно в татарском, башкирском и казахском, слово «сафа» означает «чистота», «непорочность», а также «ясность» и «прозрачность». Это имя нередко давали мальчикам, желая им чистой души и честной жизни. Встречается оно и в арабском мире, где «Сафа» — одно из имён, связанных с духовной чистотой.

Модель образования фамилии необычна для русского уха. В русской традиции фамилии чаще всего заканчиваются на -ов, -ев, -ин. Здесь же мы видим окончание -ена, что характерно для фамилий, возникших в среде тюркских народов Поволжья и Приуралья. Суффикс -ен(а) в тюркских фамилиях часто указывает на принадлежность к роду или на происхождение от отца. Таким образом, Сафена буквально означает «принадлежащий Сафе», «сын Сафы» или «из рода Сафы». Это патронимическая фамилия, но оформленная по тюркской, а не по русской модели.

Вероятнее всего, фамилия Сафена имеет татарские или башкирские корни. Среди татар и башкир широко распространены фамилии, образованные от личных имён с помощью подобных аффиксов: Ахметов, Ибрагимов — это русифицированные формы, а вот Сафена, Алеева, Сюндюкова — примеры, где тюркская основа сохранила свой грамматический строй. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крещёными татарами или башкирами, либо фамилия закрепилась в среде мишарей или тептярей.

В русских документах эта фамилия встречается редко, что подтверждает её локальный, региональный характер. Сравните с однокоренными, но русифицированными фамилиями Сафин, Сафонов (от Сафон, народной формы Софония) или Сафаров. Сафена стоит особняком — она не потеряла своего тюркского окончания, что делает её ценным маркером для генеалогического поиска. Если вы ищете свои корни, стоит обратить внимание на юго-восток Татарстана, северо-запад Башкортостана или Оренбургскую область — именно там чаще всего фиксируются фамилии такой модели.