Фамилия Сафрончева образована от мужского имени Сафрон — народной формы канонического крестильного имени Софроний. В древнегреческом языке «софрониос» означает «здравомыслящий, благоразумный, рассудительный». На русской почве имя прошло через ряд фонетических изменений: начальное Со- в разговорной речи часто переходило в Са- (ср. Сократ — Сократ, но также и Сакрат), а сочетание -фр- сохранялось, давая формы Сафрон, Сафроний. Имя было распространено среди всех сословий, особенно в крестьянской и купеческой среде.

Основа Сафрон- в фамилии осложнена суффиксом -чев-, что встречается реже, чем стандартное -ов/-ев. Модель «имя + -чев» характерна для фамилий, образованных от прозвищ или имён с основой на мягкий согласный или шипящий (ср. Абрамчев, Исайчев). В случае Сафрончева суффикс мог возникнуть из-за того, что в говорах имя произносили как Сафронец или Сафронч — с уменьшительным суффиксом -ец или -ч. Тогда фамилия буквально значит «сын Сафронца» или «потомок того, кого называли Сафронч». Форма Сафрончева — женская, принадлежащая женщине; мужской вариант — Сафрончев.

Географически фамилия привязана к северным и центральным областям России. По данным современных переписей, носители сосредоточены в Вологодской, Архангельской и Кировской областях, а также встречаются в Поволжье. Это указывает на то, что предки Сафрончевых были, скорее всего, государственными или помещичьими крестьянами, жившими в условиях северного земледелия и промыслов. В документах XVII–XVIII веков фамилия не фиксируется, что говорит о её относительно позднем оформлении — вероятно, в XIX веке, когда крестьянам начали массово присваивать фамилии по имени отца.

С точки зрения словообразования интересно, что фамилия избежала стандартного суффикса -ов, который в русском языке считается «нейтральным». Вариант на -чев подчёркивает диалектную или локальную особенность произношения: в некоторых говорах имена на -он могли получать уменьшительную форму с -ч- (как Иван — Иванович, но в быту Иванчо, Иванча). Таким образом, Сафрончева — не просто «дочь Сафрона», а «дочь того, кого в семье или деревне звали Сафрончем». Эта деталь делает фамилию более живой и привязанной к конкретному говору, нежели её «стандартные» аналоги вроде Сафронова или Сафронова.