Фамилия Саганбаева, как и большинство фамилий с суффиксом -ев, происходит от отчества, образованного от мужского имени Саганбай. Это тюркская, скорее всего казахская или башкирская, фамилия, где основа «Саган» восходит к древнетюркскому слову «саган» — «считающий», «думающий», «мудрый», либо к имени собственному, которое могло быть дано ребёнку как пожелание ума и рассудительности. Компонент «бай» в тюркских именах означает «богатый», «господин», «хозяин», поэтому имя Саганбай можно перевести как «богатый умом» или «мудрый господин».

Формант -ев указывает на принадлежность: Саганбаев — буквально «сын Саганбая». В русской традиции при оформлении фамилий для народов Поволжья, Урала и Центральной Азии часто использовали именно русские патронимические суффиксы, поэтому тюркское имя легко встроилось в модель русской фамилии. Окончание -а (Саганбаева) — женский вариант фамилии, образованный по тому же принципу.

Интересно, что фамилия Саганбаева не имеет прямых аналогов среди славянских корней — это чисто тюркское образование, которое в русской среде стало восприниматься как фамилия только после фиксации в документах. В отличие от более распространённых фамилий на -ов, основа здесь не прозвище, а полноценное личное имя, что типично для народов, где имянаречение было многосоставным и несло пожелание качеств.

Регионально фамилия чаще всего встречается в Казахстане, Башкортостане и Татарстане, реже — среди русских, чьи предки могли быть крещёными татарами или башкирами. Если искать социальный контекст, носители фамилии в XIX веке могли быть как кочевниками-скотоводами, так и оседлыми крестьянами, но точных данных о сословной принадлежности нет — фамилия не указывает на дворянство или духовенство, а фиксирует просто родство по отцу.

В ономастических словарях фамилия Саганбаева не описана подробно, но её разбор по тюркским компонентам надёжен: «саган» как «счёт, разум» подтверждается параллелями в именах Саган, Саганат. Альтернативная версия — связь с монгольским «цаган» (белый), но для тюркских языков это менее характерно, так как в казахском и башкирском «белый» передаётся иначе.